{"id":7260,"date":"2021-01-21T15:48:41","date_gmt":"2021-01-21T20:48:41","guid":{"rendered":"https:\/\/canarie.machinedev.ca\/rne\/case-studies\/bcnet\/"},"modified":"2021-03-25T15:25:44","modified_gmt":"2021-03-25T19:25:44","slug":"bcnet","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/www.canarie.ca\/fr\/rnre\/etudes-de-cas\/bcnet\/","title":{"rendered":"BCNET"},"content":{"rendered":"\n\n
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Poser les bases de la sant\u00e9 g\u00e9n\u00e9tique<\/h1>\n \t\t \t\t <\/div>\n <\/div>\n <\/div>\n<\/section>\n\n\n\n\n\n

\u00c9tude de cas du RNRE par BCNET<\/a><\/strong><\/p>\n\n\n\n

Une mani\u00e8re s\u00fbre d\u2019exploiter les donn\u00e9es m\u00e9dicales<\/h3>\n\n\n\n

Le s\u00e9quen\u00e7age de l\u2019ADN est d\u00e9sormais chose courante et, qui plus est, bon march\u00e9. Il en a r\u00e9sult\u00e9 une multitude d\u2019applications qui font usage des donn\u00e9es issues du g\u00e9nome et servent \u00e0 identifier les malfaiteurs, \u00e0 valider l\u2019utilit\u00e9 des ingr\u00e9dients m\u00e9dicinaux et \u00e0 prot\u00e9ger la faune. Des services de g\u00e9notypage \u00e0 l\u2019intention du consommateur proposent maintenant d\u2019\u00e9tablir l\u2019ascendance de chacun ou les risques que l\u2019h\u00e9r\u00e9dit\u00e9 soul\u00e8ve pour la sant\u00e9. Cependant, une nouvelle utilisation du s\u00e9quen\u00e7age de l\u2019ADN se pointe \u00e0 l\u2019horizon : les plans de traitement personnalis\u00e9s. En d\u00e9cryptant le g\u00e9nome, les caract\u00e8res individuels et les ant\u00e9c\u00e9dents m\u00e9dicaux de ceux qui b\u00e9n\u00e9ficient de soins de sant\u00e9, on commence \u00e0 se faire une id\u00e9e des traitements qui fonctionneront le mieux pour telle ou telle personne pr\u00e9sentant certains g\u00e8nes ou souffrant d\u2019un trouble h\u00e9r\u00e9ditaire particulier. Au bout du compte, on forgera des traitements qui cibleront avec une grande pr\u00e9cision la maladie d\u2019Alzheimer, la fibrose kystique, diverses formes de cancer et d\u2019autres affections.<\/p>\n\n\n\n

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Toutefois, la gestion, le partage et le traitement de donn\u00e9es aussi volumineuses que celles venant du g\u00e9nome humain soul\u00e8vent des difficult\u00e9s. En effet, analyser ces donn\u00e9es requiert d\u2019\u00e9normes ressources informatiques. La t\u00e2che est titanesque, car une personne repr\u00e9sentera \u00e0 elle seule environ trois t\u00e9raoctets (l\u2019\u00e9quivalent de plus de 4 500 CD) de donn\u00e9es g\u00e9n\u00e9tiques. Une autre difficult\u00e9, \u00e0 ne pas n\u00e9gliger, de la recherche en g\u00e9nomique a trait \u00e0 la protection des renseignements personnels \u2013 ou plut\u00f4t, au risque qu\u2019on les \u00e9gare. Les donn\u00e9es g\u00e9nomiques sont habituellement conserv\u00e9es en lieu s\u00fbr dans les nombreux h\u00f4pitaux, centres universitaires et instituts m\u00e9dicaux qui les recueillent, mais les chercheurs comptent absolument sur la collaboration entre institutions pour amasser des \u00e9chantillons de la taille ad\u00e9quate et effectuer des d\u00e9ductions vitales.<\/p>\n\n\n\n

Qu\u2019est-ce que le RNRE?<\/strong><\/strong><\/p>

Le R\u00e9seau national de recherche et d\u2019\u00e9ducation (RNRE) est un regroupement d\u2019infrastructures, d\u2019outils et de personnes d\u2019une importance capitale dont la raison d\u2019\u00eatre est de rehausser le leadership du Canada dans les domaines de la recherche, de l\u2019enseignement et de l\u2019innovation. Les partenaires du RNRE canadien coop\u00e8rent afin de rendre cette infrastructure indispensable encore plus s\u00fbre. Un projet pancanadien sans pr\u00e9c\u00e9dent dans l\u2019histoire est en cours pour assurer une surveillance coordonn\u00e9e des menaces qui p\u00e8sent sur le r\u00e9seau.<\/em><\/em><\/p><\/blockquote>\n\n\n\n

Pour surmonter ces difficult\u00e9s, des chercheurs de la Colombie-Britannique et leurs homologues de l\u2019Ontario et du Qu\u00e9bec ont lanc\u00e9 le projet CanDIG. Financ\u00e9 par la Fondation canadienne pour l\u2019innovation (FCI), leur collaboration s\u2019appuie lourdement sur le R\u00e9seau national de la recherche et de l\u2019\u00e9ducation (RNRE) du Canada afin que les scientifiques partagent les jeux de donn\u00e9es en g\u00e9nomique et y acc\u00e8dent efficacement partout au pays.<\/p>\n\n\n\n

Une plateforme de recherche en g\u00e9nomique<\/h3>\n\n\n\n

CanDIG a pour but principal l\u2019\u00e9laboration d\u2019une plateforme logicielle de recherche en g\u00e9nomique, c\u2019est-\u00e0-dire une m\u00e9thode r\u00e9partie, uniformis\u00e9e et anonyme qui permettra d\u2019examiner les donn\u00e9es g\u00e9n\u00e9tiques \u00e0 des fins cliniques et scientifiques. Le RNRE, qui est constitu\u00e9 de CANARIE et de ses douze partenaires provinciaux et territoriaux, procure \u00e0 CanDIG les outils et la rapidit\u00e9 dont la plateforme a besoin pour transmettre les jeux colossaux de donn\u00e9es g\u00e9nomiques aux chercheurs canadiens, et les partager avec d\u2019autres scientifiques dans le monde entier.<\/p>\n\n\n\n

Pour l\u2019instant, CanDIG ne fonctionne qu\u2019avec un nombre restreint d\u2019h\u00f4pitaux et d\u2019instituts de recherche majeurs. La plateforme prot\u00e8ge le profil, les ant\u00e9c\u00e9dents m\u00e9dicaux et les donn\u00e9es g\u00e9n\u00e9tiques du patient, l\u00e0 o\u00f9 ces informations ont \u00e9t\u00e9 glan\u00e9es, tout en laissant les chercheurs consulter les bases de donn\u00e9es r\u00e9parties, sans qu\u2019il y ait la moindre fuite de renseignements personnels. De cette mani\u00e8re, le chercheur peut \u00e9tudier les jeux de donn\u00e9es g\u00e9nomiques \u00e0 l\u2019\u00e9chelon national sans d\u00e9roger \u00e0 la r\u00e9glementation des provinces sur la protection des donn\u00e9es m\u00e9dicales.<\/p>\n\n\n\n

Tirer parti du RNRE canadien<\/h3>\n\n\n\n

Pour faciliter le projet sur le RNRE, BCNET \u00e9tablit la connexion avec les sites de CanDIG en Colombie-Britannique tandis qu\u2019ORION et le RISQ en font respectivement autant en Ontario et au Qu\u00e9bec. CANARIE assure la connectivit\u00e9 entre les provinces et avec d\u2019autres pays afin que les collaborations sur les plans national et international soient r\u00e9alisables.<\/p>\n\n\n\n

Avec un d\u00e9bit allant jusqu\u2019\u00e0 100 gigabits par seconde, le RNRE est des milliers de fois plus rapide que les r\u00e9seaux commerciaux actuels. Il ne lui faut que quatre minutes pour transf\u00e9rer trois t\u00e9raoctets de donn\u00e9es g\u00e9nomiques, par exemple, alors que 27 jours seraient n\u00e9cessaires avec une connexion normale \u00e0 Internet.<\/p>\n\n\n\n

Traitements adapt\u00e9s<\/h3>\n\n\n\n

Les importantes collaborations qu\u2019autorise le projet CanDIG engendreront des applications cliniques ultra personnalis\u00e9es avec lesquelles on pourra non seulement \u00e9tablir les soins qui conviennent le mieux \u00e0 un malade, mais aussi trouver un rem\u00e8de \u00e0 de rares maladies h\u00e9r\u00e9ditaires. Le projet permettra \u00e9galement de r\u00e9pondre de mani\u00e8re plus compl\u00e8te aux interrogations que soul\u00e8vent la sant\u00e9 et l\u2019\u00e9volution des maladies associ\u00e9es \u00e0 l\u2019ADN ou \u00e0 l\u2019ARN et les risques connexes.<\/p>\n\n\n\n

D\u00e8s que les essais initiaux auront d\u00e9montr\u00e9 l\u2019utilit\u00e9 de CanDIG, la plateforme sera d\u00e9ploy\u00e9e dans les institutions universitaires, scientifiques et m\u00e9dicales du pays. Les chercheurs auront donc acc\u00e8s \u00e0 une base de donn\u00e9es beaucoup plus riche en g\u00e9n\u00e9tique. Le RNRE, qui connecte pr\u00e8s de 715 universit\u00e9s, h\u00f4pitaux et laboratoires de recherche au Canada est l\u2019infrastructure id\u00e9ale pour autoriser un aussi vaste regroupement de chercheurs en sant\u00e9.<\/p>\n\n\n\n

Une alliance internationale<\/h3>\n\n\n\n

CanDIG illustre \u00e0 merveille le leadership du Canada en science. L\u2019an dernier, la Global Alliance for Genomics and Health (GA4GH) a retenu la plateforme en vue de l\u2019\u00e9laboration de normes internationales en g\u00e9nomique. L\u2019Alliance s\u00e9lectionne les projets qui font progresser l\u2019\u00e9change des donn\u00e9es en g\u00e9nomique et pourraient avoir un v\u00e9ritable impact mondial. Dans le cas pr\u00e9sent, on esp\u00e8re cr\u00e9er des normes internationales qui s\u2019appliqueront \u00e0 l\u2019\u00e9change des donn\u00e9es en g\u00e9nomique humaine. T\u00e9moignage du leadership canadien dans la recherche en g\u00e9nomique, CanDIG pave la voie aux retomb\u00e9es plan\u00e9taires qu\u2019une individualisation des traitements m\u00e9dicaux laisse imaginer.<\/p>\n\n\n\n

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En savoir plus de BCNET, visitez :<\/h2>\n
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