La r\u00e9utilisation des logiciels acc\u00e9l\u00e8re la d\u00e9couverte et optimise l\u2019impact des sommes que le tr\u00e9sor public investit dans la recherche<\/p>\n
[Ottawa, ON]<\/p>\n
Aujourd\u2019hui, CANARIE a d\u00e9voil\u00e9 les 13 projets qui ont \u00e9t\u00e9 retenus \u00e0 la suite du dernier appel lanc\u00e9 dans le cadre de son programme \u00ab Logiciels de recherche \u00bb. En subventionnant ces projets, l\u2019organisme permettra aux \u00e9quipes de recherche d\u2019adapter leurs plateformes pour que d\u2019autres \u00e9quipes puissent s\u2019en servir, notamment celles poursuivant des travaux dans d\u2019autres disciplines. De cette fa\u00e7on, de nouvelles \u00e9quipes de recherche un peu partout au pays pourront recourir aux logiciels \u00e9labor\u00e9s gr\u00e2ce \u00e0 un financement ant\u00e9rieur afin d\u2019intensifier leurs travaux.<\/p>\n
La d\u00e9marche scientifique (acquisition de donn\u00e9es, stockage, calculs\/traitement, visualisation et gestion des r\u00e9sultats) est la m\u00eame, peu importe la discipline dans laquelle s\u2019effectuent les recherches. En adaptant les logiciels d\u00e9velopp\u00e9s sp\u00e9cifiquement pour faciliter cette d\u00e9marche afin que d\u2019autres \u00e9quipes puissent s\u2019en servir, on optimisera l\u2019impact des sommes que les organismes publics injectent dans la recherche et parviendra plus rapidement \u00e0 des d\u00e9couvertes:<\/p>\n
Le financement de ces projets a \u00e9t\u00e9 rendu possible gr\u00e2ce aux 137\u00a0millions de dollars que le gouvernement du Canada a octroy\u00e9 \u00e0 CANARIE pour son mandat de 2020 \u00e0 2024.<\/p>\n
\u00ab\u00a0Pouvoir se connecter, \u00e9changer des donn\u00e9es et collaborer avec des chercheurs des quatre coins du pays et du monde est une priorit\u00e9 pour notre gouvernement\u00a0\u00bb, a d\u00e9clar\u00e9 l\u2019honorable Navdeep Bains, ministre de l\u2019Innovation, des Sciences et de l\u2019Industrie<\/strong>. \u00ab\u00a0Les fonds annonc\u00e9s aujourd\u2019hui concourront \u00e0 acc\u00e9l\u00e9rer la d\u00e9couverte au Canada et aidant nos chercheurs \u00e0 trouver, \u00e0 consulter et \u00e0 r\u00e9utiliser plus facilement des donn\u00e9es en collaboration avec leurs coll\u00e8gues du Canada et d\u2019ailleurs.\u00a0\u00bb<\/p><\/blockquote>\n
\u00c9quipes de recherche subventionn\u00e9es<\/h2>\n
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- CBRAIN<\/strong><\/a> | sous la direction d\u2019Alan C. Evans (Ph. D.), Universit\u00e9 McGill<\/strong><\/li>\n<\/ul>\n
Cette plateforme de collaboration en recherche, accessible par le Web, simplifie l\u2019exploitation des jeux volumineux de donn\u00e9es conserv\u00e9s sur une infrastructure nationale de calcul informatique de pointe en nuage. CANARIE a commenc\u00e9 \u00e0 subventionner CBRAIN en 2009. Depuis, la plateforme a jou\u00e9 un r\u00f4le capital dans la recherche en neuro-imagerie.<\/p>\n
\u00c9volution du logiciel\u00a0<\/em>: deux nouveaux flux de travail s\u2019ajouteront \u00e0 la plateforme pour g\u00e9rer les donn\u00e9es autrement et \u00e9pauler plus de chercheurs dans d\u2019autres domaines.<\/p>\n
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- SlicerAIGT<\/strong><\/a> | sous la direction de Gabor Fichtinger (Ph. D.), Universit\u00e9 Queen\u2019s<\/strong><\/li>\n<\/ul>\n
Cette plateforme autorise le d\u00e9veloppement rapide d\u2019applications guid\u00e9es par l\u2019image, par exemple des interventions chirurgicales durant lesquelles le m\u00e9decin se fie aux images g\u00e9n\u00e9r\u00e9es par un ordinateur plut\u00f4t qu\u2019\u00e0 la vision directe des organes. Deux modules de Slicer ont d\u00e9j\u00e0 b\u00e9n\u00e9fici\u00e9 de l\u2019aide financi\u00e8re de CANARIE.<\/p>\n
\u00c9volution du logiciel\u00a0<\/em>: SlicerAIGT ajoutera un module d\u2019intelligence artificielle \u00e0 la plateforme. L\u2019application fera appel \u00e0 l\u2019apprentissage automatique pour isoler et identifier les particularit\u00e9s qui apparaissent sur l\u2019image m\u00e9dicale.<\/p>\n
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- LORIS<\/strong><\/a> | sous la direction d\u2019Alan C. Evans (Ph.\u00a0D.), Universit\u00e9 McGill<\/strong><\/li>\n<\/ul>\n
Cette plateforme aide les chercheurs \u00e0 rassembler, \u00e0 structurer et \u00e0 partager les donn\u00e9es lors de collaborations entre diff\u00e9rentes disciplines. Elle avait d\u2019abord \u00e9t\u00e9 \u00e9labor\u00e9e \u00e0 l\u2019Institut neurologique de Montr\u00e9al dans le cadre d\u2019une \u00e9tude sur le d\u00e9veloppement de l\u2019enc\u00e9phale en p\u00e9diatrie. Dor\u00e9navant, LORIS appuiera les projets de recherche poursuivis \u00e0 diff\u00e9rents endroits dans 22\u00a0pays sites en \u00e9tablissant des liens entre les donn\u00e9es sur le cerveau, le comportement et les g\u00e8nes.<\/p>\n
\u00c9volution du logiciel\u00a0<\/em>: La plateforme LORIS sera \u00e9largie pour inclure les donn\u00e9es des \u00e9lectroenc\u00e9phalogrammes (EEG) et faciliter la recherche sur le sommeil ainsi que la cartographie du cerveau humain.<\/p>\n
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- Motus<\/strong><\/a> | sous la direction de Denis Lepage (Ph. D.), Oiseaux Canada <\/strong><\/li>\n<\/ul>\n
Motus est un r\u00e9seau de collaboration en recherche international qui recourt \u00e0 des capteurs coordonn\u00e9s automatiquement pour suivre les d\u00e9placements locaux, r\u00e9gionaux et continentaux de petits animaux (oiseaux, chauve-souris, insectes). Ce syst\u00e8me de surveillance de la faune a vu le jour en 2012 gr\u00e2ce au soutien financier suppl\u00e9mentaire que CANARIE lui a accord\u00e9 en 2016.<\/p>\n
\u00c9volution du logiciel\u00a0<\/em>: Pour que de nouvelles \u00e9quipes scientifiques adoptent la plateforme, Motus int\u00e8grera de nouvelles technologies de pistage, perfectionnera son interface utilisateur et deviendra interop\u00e9rable avec d\u2019autres plateformes de recherche.<\/p>\n
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- IRIDA<\/strong><\/a> | sous la direction de William Hsiao (Ph.\u00a0D.), Universit\u00e9 Simon Fraser <\/strong><\/li>\n<\/ul>\n
IRIDA est une plateforme d\u2019analyse en g\u00e9nomique extensible de source ouverte dont on se sert pour analyser rapidement et efficacement le g\u00e9nome des microorganismes. S\u00e9quencer l\u2019enti\u00e8ret\u00e9 du g\u00e9nome est une puissante m\u00e9thode de recherche quand on \u00e9tudie les maladies infectieuses et l\u2019\u00e9volution des agents pathog\u00e8nes, car cette technique garantit une r\u00e9solution \u00e9lev\u00e9e, une grande efficacit\u00e9 et une importante \u00e9conomie de moyens.<\/p>\n
\u00c9volution du logiciel\u00a0<\/em>: Pour augmenter le nombre d\u2019utilisateurs, la plateforme IRIDA (que CANARIE avait financ\u00e9e au d\u00e9part en 2018) ajoutera des flux de travail dans de nouveaux domaines et am\u00e9liorera son interface. Dans la lutte contre la pand\u00e9mie de COVID-19, on recourt \u00e0 IRIDA pour coordonner le partage et l\u2019analyse des donn\u00e9es sur le r\u00e9seau canadien de la sant\u00e9 publique. Pour faciliter la coop\u00e9ration scientifique avec l\u2019Europe, la plateforme conna\u00eetra aussi des am\u00e9liorations au niveau de l\u2019exportation des donn\u00e9es, afin que celles-ci puissent \u00eatre vers\u00e9es dans l\u2019European Nucleotide Archive (ENA).<\/p>\n
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- OpenMS<\/strong><\/a> | sous la direction de Hannes Rost (Ph.\u00a0D.), Universit\u00e9 de Toronto<\/strong><\/li>\n<\/ul>\n
OpenMS regroupe une gamme d\u2019outils informatiques avec lesquels les chercheurs exploitent plus efficacement la spectrom\u00e9trie de masse, technique permettant d\u2019\u00e9tablir avec une grande pr\u00e9cision la masse des diff\u00e9rentes mol\u00e9cules qui composent un \u00e9chantillon.<\/p>\n
\u00c9volution du logiciel\u00a0<\/em>: Les h\u00f4pitaux universitaires du monde entier se sont activement lanc\u00e9s dans la qu\u00eate de biomarqueurs, signature mol\u00e9culaire permettant de d\u00e9pister une maladie d\u00e8s les premiers sympt\u00f4mes, de dresser un plan th\u00e9rapeutique plus rapidement et d\u2019en pr\u00e9dire l\u2019issue. Dans le cadre de ce projet, on modifiera OpenMS en vue de d\u00e9couvrir et de valider des biomarqueurs dans les flux complexes de donn\u00e9es qu\u2019engendrent les spectrom\u00e8tres de masse.<\/p>\n
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- Atlascine<\/strong><\/a> | <\/strong><\/strong>sous la direction de S\u00e9bastien Caquard (Ph.\u00a0D.), Universit\u00e9 Concordia<\/strong><\/li>\n<\/ul>\n
Subventionn\u00e9e au d\u00e9part par CANARIE en 2018, la plateforme de source ouverte Atlascine permet aux chercheurs de nombreuses disciplines d\u2019\u00e9tiqueter et de cartographier de fa\u00e7on interactive des r\u00e9cits. Ensuite, on recourt \u00e0 la carte obtenue pour illustrer les lieux o\u00f9 se d\u00e9roule le r\u00e9cit et naviguer de l\u2019un \u00e0 l\u2019autre en qu\u00eate de renseignements sp\u00e9cifiques.<\/p>\n
\u00c9volution du logiciel\u00a0<\/em>: Atlascine inclura une carte interactive qui rassemblera les donn\u00e9es sur de multiples r\u00e9cits, afin d\u2019am\u00e9liorer l\u2019analyse de complexes sch\u00e9mas spatiaux dans d\u2019importantes anthologies. La plateforme se d\u00e9ploiera d\u2019elle-m\u00eame, ce qui en facilitera l\u2019adoption par un large \u00e9ventail de chercheurs.<\/p>\n
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- Overture<\/strong><\/a> | sous la direction de Christina Yung (Ph.\u00a0D.), Ontario Institute for Cancer Research <\/strong><\/li>\n<\/ul>\n
Overture est une s\u00e9rie de logiciels compos\u00e9e de modules adaptables et extensibles employ\u00e9e pour la recherche sur les jeux volumineux de donn\u00e9es en g\u00e9nomique. Elle emmagasine et distribue les jeux de donn\u00e9es tout en offrant un syst\u00e8me d\u2019authentification et d\u2019autorisation, de m\u00eame qu\u2019un portail convivial qui permet de fureter dans les donn\u00e9es ou de les retrouver.<\/p>\n
\u00c9volution du logiciel\u00a0<\/em>: Pour que de nouvelles \u00e9quipes scientifiques adoptent la plateforme, on en simplifiera l\u2019installation et la configuration. Overture sera aussi dot\u00e9 d\u2019autres fonctions d\u2019authentification et on rendra le portail encore plus adaptable.<\/p>\n
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- GenAP<\/strong><\/a> | <\/strong><\/strong>sous la direction de Pierre-\u00c9tienne Jacques (Ph.\u00a0D.), Universit\u00e9 de Sherbrooke<\/strong><\/li>\n<\/ul>\n
Depuis le financement initial accord\u00e9 par CANARIE en 2013, la plateforme d\u2019analyse en g\u00e9n\u00e9tique et en g\u00e9nomique GenAP a simplifi\u00e9 l\u2019acc\u00e8s aux ressources de calcul informatique de pointe de Calcul Canada pour plus de 200\u00a0chercheurs en sciences de la vie.<\/p>\n
\u00c9volution du logiciel\u00a0<\/em>: Afin de r\u00e9pondre \u00e0 la demande venant d\u2019un nombre croissant d\u2019utilisateurs dans de nouvelles disciplines qui font un usage massif des donn\u00e9es, on mettra \u00e0 l\u2019\u00e9chelle les capacit\u00e9s d\u2019analyse computationnelle et les flux de travaux scientifiques de GenAP.<\/p>\n
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- PAVICS-Hydro (Phase 2)<\/strong><\/a> | <\/strong><\/strong>sous la direction de Richard Arsenault (Ph.\u00a0D.), \u00c9cole de technologie sup\u00e9rieure (\u00c9TS)<\/strong><\/li>\n<\/ul>\n
La plateforme PAVICS (acronyme de Power Analytics for Visualization of Climate Science<\/em> ou analyse de puissance pour visualiser la climatologie) rassemble des services d\u2019analyse du climat comme la consultation, le traitement et la visualisation des donn\u00e9es. Sa cr\u00e9ation avait d\u2019abord \u00e9t\u00e9 subventionn\u00e9e par CANARIE en 2018. Son objectif g\u00e9n\u00e9ral est d\u2019\u00e9pauler des chercheurs dans les disciplines qui ont de plus en plus besoin de donn\u00e9es climatiques dans leurs travaux et leurs activit\u00e9s.<\/p>\n
\u00c9volution du logiciel\u00a0<\/em>: PAVICS-Hydro ajoutera des techniques de mod\u00e9lisation pour les exutoires des bassins hydrographiques diss\u00e9min\u00e9s. D\u2019autres modifications de nature g\u00e9n\u00e9rique faciliteront la recherche, le d\u00e9veloppement et la formation.<\/p>\n
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- CANFAR<\/strong><\/a> | sous la direction de Kimberly Venn (Ph. D.), Universit\u00e9 de Victoria <\/strong><\/li>\n<\/ul>\n
La plateforme CANFAR (acronyme de Canadian Advanced Network for Astronomy Research<\/em> ou r\u00e9seau canadien \u00e9volu\u00e9 pour la recherche en astronomie) simplifie l\u2019acc\u00e8s aux projets d\u2019astronomie qui exploitent les donn\u00e9es massives venant des t\u00e9lescopes canadiens et de l\u2019infrastructure de Calcul Canada. CANFAR a obtenu des fonds de CANARIE pour la premi\u00e8re fois en 2011.<\/p>\n
\u00c9volution du logiciel\u00a0<\/em>: Les nouveaux modules de CANFAR permettront aux \u00e9quipes de recherche d\u2019adapter l\u2019usage de leurs ressources en nuage \u00e0 l\u2019analyse et au stockage des donn\u00e9es. Pour la toute premi\u00e8re fois, les chercheurs pourront aussi \u00e9laborer des flux de travaux scientifiques interactifs, reposant sur la consultation de jeux massifs de donn\u00e9es au moyen d\u2019un navigateur. En outre, ils pourront contr\u00f4ler ces flux et les partager avec leurs collaborateurs.<\/p>\n
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- iEnvironment<\/strong><\/a> | sous la direction de Donald D. Cowan (Ph.\u00a0D.), Universit\u00e9 de Waterloo<\/strong><\/li>\n<\/ul>\n
D\u2019abord financ\u00e9e par CANARIE en 2017, la plateforme iEnvironment rend les sciences de l\u2019environnement et la recherche en g\u00e9nie sur la surface de l\u2019eau plus faciles en permettant aux chercheurs d\u2019acc\u00e9der ais\u00e9ment aux donn\u00e9es environnementales et de les partager.<\/p>\n
\u00c9volution du logiciel\u00a0<\/em>: Pour aider de nouvelles \u00e9quipe de recherche sur l\u2019eau de surface de maintes disciplines, iEnvironment se dotera de nouvelles fonctionnalit\u00e9s qui autoriseront la r\u00e9utilisation et la surveillance des donn\u00e9es et des applications, la gestion des adaptations ainsi que la visualisation et le traitement de pointe des donn\u00e9es.<\/p>\n
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- OpenPNM<\/strong><\/a> and <\/strong>PoreSpy<\/strong><\/a> | sous la direction de Jeff Gostick (Ph.\u00a0D.), Universit\u00e9 de Waterloo<\/strong><\/li>\n<\/ul>\n
Gr\u00e2ce \u00e0 ces plateformes, les scientifiques et les ing\u00e9nieurs sp\u00e9cialis\u00e9s dans les mat\u00e9riaux peuvent \u00e9tudier les structures au niveau des pores, capacit\u00e9 aussi unique qu\u2019indispensable si l\u2019on veut comprendre comment les fluides, les \u00e9lectrons et la chaleur circulent dans les mat\u00e9riaux poreux. Le financement d\u2019OpenPNM par CANARIE remonte \u00e0 2017.<\/p>\n
\u00c9volution du logiciel\u00a0<\/em>: Pour appuyer de nouvelles \u00e9quipes scientifiques, on optimisera la performance des deux plateformes et on leur ajoutera des fonctionnalit\u00e9s qui faciliteront la recherche sur les mat\u00e9riaux tendres et les structures g\u00e9ologiques.<\/p>\n
Les nouveaux logiciels \u00e9labor\u00e9s gr\u00e2ce aux fonds de CANARIE exploitent les logiciels d\u00e9velopp\u00e9s ant\u00e9rieurement qu\u2019on retrouve sur le Portail des logiciels de recherche<\/a>. Par la suite, les nouveaux logiciels enrichiront le r\u00e9pertoire du portail afin que d\u2019autres chercheurs puissent s\u2019en servir, ce qui se soldera par d\u2019importantes \u00e9conomies d\u2019efforts et d\u2019argent gr\u00e2ce \u00e0 la puissance d\u2019un tel cycle de d\u00e9veloppement et de r\u00e9utilisation.<\/p>\n
Renseignements<\/h3>\n